Žáci Hudebního oddělení (HO) začínají první dva roky v PHV - Přípravná hudební výchova. PHV 1 obsahuje v prvním pololetí dvě společné hodiny (děti ještě nehrají na nástroj, teprve se připravují), ve druhém pololetí mají jednu hodinu společnou a jednu v malé skupince u učitele na nástroj (přehled vyučovaných nástrojů v sekci Obory a nástroje). Druhý rok přípravné hudební výchovy - PHV 2 má také jednu hodinu společnou (PHV 2) a jednu ve skupince u učitele na nástroj.
Na základě domluvy s rodiči, dětmi a mezi učiteli je v dalším roce žák zařazen do 1. ročníku. Získává tak většinou samostatnou hodinu na nástroji a druhou hodinu absolvuje až do 5. ročníku na povinné Hudební nauce (HN 1-5). Podle uvážení učitelů a podle věku hrají děti také v komorních orchestrech - souborech (viz níže). Vystoupení na Žákovských koncertech je povinnou součástí výuky.
V rámci Hudebního oddělení zde působí pěvecký sbor
a různé druhy souborů se stabilním nástrojovým obsazením
(smyčcový, flétnový, lidový, klarinetový).